Under the Crystal Sky, gökyüzünde beliren ve tüm kasabayı şaşkına çeviren garip bir ışık gösterisiyle başlar. Bir Yerli ailesi, bu olağanüstü fenomeni gözleriyle görürken, hemen sonrasında yaşadıkları kasaba UFO kazasıyla sarsılır. Başlangıçta bu olayları anlamlandırmaya çalışan aile, kısa süre içinde hem kendi geçmişlerinden hem de kasabanın derinliklerinden gelen eski korkularla yüzleşmek zorunda kalır. Korku, kasaba halkının içinde yayılırken, gizemli olayların sıklığı artar. Yerli ailenin yaşadığı topraklar üzerinde yabancı askeri güçlerin varlığı da giderek daha belirgin hale gelir.
