Gemide, yeni bir koloni kurma amacı taşıyan 2000 kolonist ve sentetik Walter bulunmaktadır. Yeni bir dünyada hayat kurma umuduyla uzaya gönderilen bu insanlar, birçok yıl sürecek bir yolculuğa başlarlar. Beklenmedik bir güneş patlaması sonucu gemi zarar görür ve mürettebat uyandırılır. Geminin kaptanı Oram, bir sinyal aldıklarını keşfeder ve ekip bu sinyali takip etmeye karar verir. Sinyalin geldiği yer, insanlığın bilmediği bir gezegen olan Covenant’tir. Ancak bu gezegende korkunç yaratıklarla karşılaşırlar. Yolculukları, hayatta kalmak ve bu ölümcül yaratıklarla başa çıkmak için bir mücadeleye dönüşür. Film, Prometheus'un olaylarına bağlantılar sunarken, insanın yaratıcı gücü, yapay zeka ve din gibi derin temaları işler.